呼伦贝尔市蒙医医院（呼伦贝尔市蒙医药研究所）是呼伦贝尔市卫生健康委员会所属事业单位，国家公立三级乙等民族（蒙医综合医院）医院，始建于1978年。医院坚持发挥蒙医药特色优势，集临床治疗、科研教学、预防保健、蒙药制剂、医养结合、健康旅游、国际交流、草药种植等为一体，承担着呼伦贝尔地区蒙医药文化传承、发展和蒙医药国际及地区间交流的重任，是内蒙古医科大学教学实践基地、内蒙古民族大学校外研究生培养基地、呼伦贝尔职业技术学院教学实践基地。

医院（总院）座落于呼伦贝尔市海拉尔区，分设扎兰屯院区、新区院区、治未病中心、老年健康服务中心、国家级蒙医住院医师规范化培训基地、蒙药材标准化种植基地。2022年实施国家特色医院建设项目，新院址建设项目计划于2025年投入使用。